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一键生成可复现的公共生物数据下载计划与校验清单
public-data-access
public-data-access 是 SkillFeeder 收录的Agent Skill，来自 GitHub 仓库 xuzhougeng/wisp-science，★ 1,069。一键生成可复现的公共生物数据下载计划与校验清单。适合生物信息分析员、计算生物学研究员。场景是Agent工具链 · 提示词工作流。能做的事包括自动生成含校验码的下载清单、统一接入 GEO/SRA/GDC/GTEx/DepMap 多源数据、输出 R 友好 SOFT/Series Matrix 元数据。打开 GitHub 自行安装。
能做什么
- 自动生成含校验码的下载清单
- 统一接入 GEO/SRA/GDC/GTEx/DepMap 多源数据
- 输出 R 友好 SOFT/Series Matrix 元数据
原文简介
Plan, validate, and document public-bioinformatics data acquisition for GEO/GSE/GSM/GPL/GDS, SRA/ENA, TCGA/GDC, GTEx, and DepMap. Covers expression matrices, raw reads, download manifests, caches, and optional geokit SOFT/Series Matrix acquisition for R workflows.
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